Mus musculus Gene: Slc4a4 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-177669.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Slc4a4 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | solute carrier family 4 (anion exchanger), member 4 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI835705; NBC; NBC1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000060961 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
solute carrier family 4 (anion exchanger), member 4
solute carrier family 4 (anion exchanger), member 4
solute carrier family 4 (anion exchanger), member 4
solute carrier family 4 (anion exchanger), member 4
solute carrier family 4 (anion exchanger), member 4
solute carrier family 4 (anion exchanger), member 4
solute carrier family 4 (anion exchanger), member 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000080493:
This gene encodes a sodium bicarbonate cotransporter (NBC) involved in the regulation of bicarbonate secretion and absorption and intracellular pH. Mutations in this gene are associated with proximal renal tubular acidosis. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:88886818-89239653 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
SLC-mediated transmembrane transport pathway
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides pathway
Bicarbonate transporters pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
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KEGG |
Bile secretion pathway
Proximal tubule bicarbonate reclamation pathway
Pancreatic secretion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Bicarbonate transporters pathway
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
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KEGG |
Proximal tubule bicarbonate reclamation pathway
Pancreatic secretion pathway
Bile secretion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3Z7I7 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 54403 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.397398 Mm.400935 Mm.404785 Mm.41044 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001136260 NM_001197147 NM_018760 XM_006535138 XM_006535139 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19406 CCDS51541 CCDS57352 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1927555 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Slc4a4 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC140492 AC162690 AC165240 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 54403 | ||||||||||||||||||||||