Mus musculus Gene: Pou5f1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-178408.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pou5f1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | POU domain, class 5, transcription factor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | NF-A3; Oct-3; Oct-3/4; Oct-4; Oct3; Oct3/4; Oct4; Otf-3; Otf-4; Otf3; Otf3-rs7; Otf3g; Otf4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000024406 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
POU domain, class 5, transcription factor 1
POU domain, class 5, transcription factor 1
POU domain, class 5, transcription factor 1
POU domain, class 5, transcription factor 1
POU domain, class 5, transcription factor 1
POU domain, class 5, transcription factor 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000204531:
This gene encodes a transcription factor containing a POU homeodomain. This transcription factor plays a role in embryonic development, especially during early embryogenesis, and it is necessary for embryonic stem cell pluripotency. A translocation of this gene with the Ewing's sarcoma gene, t(6;22)(p21;q12), has been linked to tumor formation. Alternative splicing, as well as usage of alternative translation initiation codons, results in multiple isoforms, one of which initiates at a non-AUG (CUG) start codon. Related pseudogenes have been identified on chromosomes 1, 3, 8, 10, and 12. [provided by RefSeq, Mar 2010] This gene encodes a transcription factor containing a POU homeodomain that plays a key role in embryonic development and stem cell pluripotency. Aberrant expression of this gene in adult tissues is associated with tumorigenesis. This gene can participate in a translocation with the Ewing\'s sarcoma gene on chromosome 21, which also leads to tumor formation. Alternative splicing, as well as usage of alternative AUG and non-AUG translation initiation codons, results in multiple isoforms. One of the AUG start codons is polymorphic in human populations. Related pseudogenes have been identified on chromosomes 1, 3, 8, 10, and 12. [provided by RefSeq, Oct 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:35506018-35510772 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | B1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 370 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 26 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
POU5F1 (OCT4), SOX2, NANOG activate genes related to proliferation pathway
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells pathway
Developmental Biology pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Developmental Biology pathway
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells pathway
POU5F1 (OCT4), SOX2, NANOG activate genes related to proliferation pathway
POU5F1 (OCT4), SOX2, NANOG repress genes related to differentiation pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
HIF-2-alpha transcription factor network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E2JL30 E2JL33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 18999 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.17031 Mm.441730 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001252452 NM_013633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:101893 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Pou5f1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB375269 AB375272 AB375273 AB375274 AB375277 CR974473 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | BAG84134 BAG84135 BAG84136 BAG84137 BAG84138 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 18999 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||