Mus musculus Gene: Atg16l1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-178701.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Atg16l1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1500009K01Rik; Apg16l; Atg16l; WDR30 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026289 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
autophagy-related 16-like 1 (yeast)
autophagy-related 16-like 1 (yeast)
autophagy-related 16-like 1 (yeast)
autophagy-related 16-like 1 (yeast)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] ATG16L1 is involved in autophagy where it is recruited to the plasma membrane at the site of bacterial entry by NOD1 and NOD2.
[Homo sapiens] ATG16L1, a critical autophagy protein, is recruited to the plasma membrane by NOD2 during bacterial invasion.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000085978:
The protein encoded by this gene is part of a large protein complex that is necessary for autophagy, the major process by which intracellular components are targeted to lysosomes for degradation. Defects in this gene are a cause of susceptibility to inflammatory bowel disease type 10 (IBD10). Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Jun 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:87755870-87792428 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 27 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 32 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Regulation of autophagy pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Regulation of autophagy pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.410937 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001205391 NM_001205392 NM_029846 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15136 CCDS56637 CCDS56638 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||