Mus musculus Gene: Pf4 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-178816.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pf4 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | platelet factor 4 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Cxcl4; Scyb4 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000029373 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
platelet factor 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000163737:
This gene encodes a member of the CXC chemokine family. This chemokine is released from the alpha granules of activated platelets in the form of a homotetramer which has high affinity for heparin and is involved in platelet aggregation. This protein is chemotactic for numerous other cell type and also functions as an inhibitor of hematopoiesis, angiogenesis and T-cell function. [provided by RefSeq, Mar 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:90772435-90773381 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Platelet degranulation pathway
GPCR downstream signaling pathway
Hemostasis pathway
Signaling by GPCR pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Formation of Fibrin Clot (Clotting Cascade) pathway
GPCR ligand binding pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
G alpha (i) signalling events pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+ pathway
Common Pathway pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Chemokine signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Common Pathway pathway
Platelet degranulation pathway
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+ pathway
G alpha (i) signalling events pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Signaling by GPCR pathway
Formation of Fibrin Clot (Clotting Cascade) pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
GPCR ligand binding pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Chemokine signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
CXCR3-mediated signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9Z126 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3TVN6 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 56744 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_019932 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19416 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1888711 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Pf4 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AB017491 AF349465 AK159278 AK160040 CH466617 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAK30163 BAA75660 BAE34956 BAE35582 EDL05306 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 56744 | ||||||||||||||||||||||