Mus musculus Gene: Atg7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-178961.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Atg7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | autophagy related 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1810013K23Rik; Agp7; Apg7l; Atg7l; Gm21553 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000030314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
autophagy-related 7 (yeast)
autophagy-related 7 (yeast)
autophagy related 7
autophagy related 7
autophagy related 7
autophagy related 7
autophagy related 7
autophagy related 7
autophagy related 7
autophagy related 7
autophagy related 7
autophagy related 7
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Atg7 plays an essential role for autophagy during invariant natural killer T cell development.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000197548:
This gene was identified based on homology to Pichia pastoris GSA7 and Saccharomyces cerevisiae APG7. In the yeast, the protein appears to be required for fusion of peroxisomal and vacuolar membranes. The protein shows homology to the ATP-binding and catalytic sites of the E1 ubiquitin activating enzymes. [provided by RefSeq, Jan 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:114643097-114860614 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | E3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 16 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 20 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Immune System pathway
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
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KEGG |
Regulation of autophagy pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
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KEGG |
Regulation of autophagy pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | S4R1K1 S4R1U3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 74244 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001253717 NM_001253718 NM_028835 XM_006506707 XM_006506708 XM_006506709 XM_006506710 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS39598 CCDS59697 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1921494 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Atg7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC122843 AC149276 AC170088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 74244 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||