Mus musculus Gene: Cln5 | |||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-184692.6 | ||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||
Gene Symbol | Cln5 | ||||||||||||||||
Gene Name | ceroid-lipofuscinosis, neuronal 5 | ||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022125 | ||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ceroid-lipofuscinosis, neuronal 5
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Protein Structure | |||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000102805:
This gene is one of eight which have been associated with neuronal ceroid lipofuscinoses (NCL). Also referred to as Batten disease, NCL comprises a class of autosomal recessive, neurodegenerative disorders affecting children. The genes responsible likely encode proteins involved in the degradation of post-translationally modified proteins in lysosomes. The primary defect in NCL disorders is thought to be associated with lysosomal storage function.[provided by RefSeq, Oct 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:103070216-103077579 | ||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||
Band | E2.3 | ||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||
KEGG |
Lysosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||
KEGG |
Lysosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||
SwissProt | Q3UMW8 | ||||||||||||||||
TrEMBL | B2RUP8 | ||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||
Entrez Gene | 211286 | ||||||||||||||||
UniGene | Mm.396789 Mm.408433 | ||||||||||||||||
RefSeq | NM_001033242 | ||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||
CCDS | CCDS27314 | ||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2442253 | ||||||||||||||||
MGI Symbol | Cln5 | ||||||||||||||||
EMBL | AK032293 AK144635 BC025487 BC141314 BC141315 CH466544 | ||||||||||||||||
GenPept | AAH25487 AAI41315 AAI41316 BAC27797 BAE25980 EDL00493 | ||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 211286 | ||||||||||||||||