Mus musculus Gene: Tfcp2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-184756.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tfcp2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | transcription factor CP2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CP-2; CP2; D230015P20Rik; LBP-1c; LBP-1d; LBP1; LSF; Tcfcp2; UBP-1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000009733 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
transcription factor CP2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000135457:
This gene encodes a transcription factor that binds the alpha-globin promoter and activates transcription of the alpha-globin gene. The encoded protein regulates erythroid gene expression, plays a role in the transcriptional switch of globin gene promoters, and it activates many other cellular and viral gene promoters. The gene product interacts with certain inflammatory response factors, and polymorphisms of this gene may be involved in the pathogenesis of Alzheimer's disease. [provided by RefSeq, Mar 2010] This gene encodes a transcription factor that binds the alpha-globin promoter and activates transcription of the alpha-globin gene. The encoded protein regulates erythroid gene expression, plays a role in the transcriptional switch of globin gene promoters, and it activates many other cellular and viral gene promoters. The gene product interacts with certain inflammatory response factors, and polymorphisms of this gene may be involved in the pathogenesis of Alzheimer\'s disease. [provided by RefSeq, Mar 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:100502799-100552008 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 38 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by HDAC Class I
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9ERA0 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 21422 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.219040 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001289603 NM_033476 XM_006520737 XM_006520738 XM_006520739 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27840 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:98509 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Tfcp2 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK146503 AK147898 AK158682 BC022131 M84809 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF99390 AAH22131 BAE27218 BAE28214 BAE34609 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 21422 | ||||||||||||||||||||||