Homo sapiens Gene: LNX1 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-18546.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LNX1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | ligand of numb-protein X 1, E3 ubiquitin protein ligase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000072201 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ligand of numb-protein X 1
ligand of numb-protein X 1
ligand of numb-protein X 1
ligand of numb-protein X 1
ligand of numb-protein X 1
ligand of numb-protein X 1
ligand of numb-protein X 1
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a membrane-bound protein that is involved in signal transduction and protein interactions. The encoded product is an E3 ubiquitin-protein ligase, which mediates ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of proteins containing phosphotyrosine binding (PTB) domains. This protein may play an important role in tumorogenesis. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been described. A pseudogene, which is located on chromosome 17, has been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:53459301-53701405 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q12 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 173 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Notch signaling pathway
|
||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.518760 Hs.617338 Hs.629493 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001126328 NM_032622 XM_005265785 XM_005265786 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3492 CCDS47057 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 17287 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||