Mus musculus Gene: Nanog | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-185735.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Nanog | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Nanog homeobox | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2410002E02Rik; ecat4; ENK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000012396 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Nanog homeobox
Nanog homeobox
Nanog homeobox
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000111704:
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:122707489-122714633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | F1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 288 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
POU5F1 (OCT4), SOX2, NANOG activate genes related to proliferation pathway
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells pathway
Developmental Biology pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Developmental Biology pathway
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells pathway
POU5F1 (OCT4), SOX2, NANOG activate genes related to proliferation pathway
POU5F1 (OCT4), SOX2, NANOG repress genes related to differentiation pathway
POU5F1 (OCT4), SOX2, NANOG activate genes related to proliferation pathway
Developmental Biology pathway
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q80Z64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 71950 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.485537 Mm.490052 Mm.6047 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001289830 NM_001289828 NM_001289831 NM_028016 XM_006506651 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS39623 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1919200 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Nanog | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB093574 AF507043 AK010332 AY278951 AY455282 AY455285 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAO67362 AAP92157 AAS57554 AAS57556 BAC76998 BAE43219 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 71950 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||