Mus musculus Gene: Chd4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-189058.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Chd4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | chromodomain helicase DNA binding protein 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 9530019N15Rik; AA617397; BC005710; D6Ertd380e; Mi-2beta; mKIAA4075 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000063870 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chromodomain helicase DNA binding protein 4
chromodomain helicase DNA binding protein 4
chromodomain helicase DNA binding protein 4
chromodomain helicase DNA binding protein 4
chromodomain helicase DNA binding protein 4
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000111642:
The product of this gene belongs to the SNF2/RAD54 helicase family. It represents the main component of the nucleosome remodeling and deacetylase complex and plays an important role in epigenetic transcriptional repression. Patients with dermatomyositis develop antibodies against this protein. [provided by RefSeq, Jul 2008] The product of this gene belongs to the SNF2/RAD54 helicase family. It represents the main component of the nucleosome remodeling and deacetylase complex and plays an important role in epigenetic transcriptional repression. Patients with dermatomyositis develop antibodies against this protein. Somatic mutations in this gene are associated with serous endometrial tumors. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2014] |
||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:125095981-125130591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | F2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 40 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 70 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase I Transcription pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Gene Expression pathway
HDACs deacetylate histones pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
HDACs deacetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Gene Expression pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by HDAC Class I
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q6PDQ2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E9QAS4 E9QAS5 F6WR45 G5E8V7 Q3U582 Q3UFM8 Q3ULG0 Q3V265 Q3V3I7 Q6IQY9 Q8BM83 Q99JM0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 107932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.333388 Mm.475105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_145979 XM_006505285 XM_006505286 XM_006505287 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20543 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1344380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Chd4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC134529 AC166162 AK034549 AK040005 AK132004 AK145532 AK148402 AK153826 BC006035 BC058578 BC071255 CH466523 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH06035 AAH58578 AAH71255 BAC28749 BAE20563 BAE20933 BAE26488 BAE28532 BAE32198 EDK99801 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 107932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||