Mus musculus Gene: Cbx5 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-189469.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cbx5 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | chromobox 5 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2610029O15Rik; C75991; HP1; Hp1a; Hp1alpha | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000009575 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chromobox homolog 5 (Drosophila HP1a)
chromobox homolog 5 (Drosophila HP1a)
chromobox homolog 5 (Drosophila HP1a)
chromobox homolog 5 (Drosophila HP1a)
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000094916:
This gene encodes a highly conserved nonhistone protein, which is a member of the heterochromatin protein family. The protein is enriched in the heterochromatin and associated with centromeres. The protein has a single N-terminal chromodomain which can bind to histone proteins via methylated lysine residues, and a C-terminal chromo shadow-domain (CSD) which is responsible for the homodimerization and interaction with a number of chromatin-associated nonhistone proteins. The encoded product is involved in the formation of functional kinetochore through interaction with essential kinetochore proteins. The gene has a pseudogene located on chromosome 3. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:103191544-103239816 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 38 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 113 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Hemostasis pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
Hemostasis pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
E2F transcription factor network
Aurora B signaling
|
||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q61686 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3Z0U2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12419 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.262059 Mm.407060 Mm.409229 Mm.415796 Mm.416492 Mm.431478 Mm.451727 Mm.473646 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001110216 NM_001076789 NM_007626 XM_006520372 XM_006520373 XM_006520374 XM_006520375 XM_006520376 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37231 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:109372 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Cbx5 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC162693 AC164069 AF216290 AK008792 AK018349 AK019198 AK030366 AK030442 AK032975 BC004707 X99641 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF80993 AAH04707 BAB25897 BAB31173 BAB31596 BAC26923 BAC26966 BAC28107 CAA67960 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 12419 | ||||||||||||||||||||||