Mus musculus Gene: Hdac1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-191058.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Hdac1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | histone deacetylase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
histone deacetylase 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Daxx interacts with Hdac1 and represses the transcription of Il6 in TLR-triggered macrophages.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary | Currently no Entrez Summary Available. You might want to check the Summary Sections of the Orthologs. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:129516104-129542713 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | D2.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 176 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
SMAD2/3 Phosphorylation Motif Mutants in Cancer pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Mus musculus biological processes pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
Chromatin organization pathway
Disease pathway
deletions in the AMER1 gene destabilize the destruction complex pathway
Hemostasis pathway
Signaling by Wnt pathway
Signaling by WNT in cancer pathway
Loss of Function of SMAD4 in Cancer pathway
G0 and Early G1 pathway
Degradation of beta-catenin by the destruction complex pathway
repression of WNT target genes pathway
Signaling by TGF-beta Receptor Complex in Cancer pathway
TGFBR1 LBD Mutants in Cancer pathway
AMER1 mutants destabilize the destruction complex pathway
Cell Cycle pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
AXIN mutants destabilize the destruction complex, activating WNT signaling pathway
T41 mutants of beta-catenin aren't phosphorylated pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants pathway
Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity pathway
Loss of Function of TGFBR2 in Cancer pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
deactivation of the beta-catenin transactivating complex pathway
formation of the beta-catenin:TCF transactivating complex pathway
APC truncation mutants have impaired AXIN binding pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
misspliced LRP5 mutants have enhanced beta-catenin-dependent signaling pathway
RNF mutants show enhanced WNT signaling and proliferation pathway
phosphorylation site mutants of CTNNB1 are not targeted to the proteasome by the destruction complex pathway
deletions in the AXIN genes in hepatocellular carcinoma result in elevated WNT signaling pathway
Signaling by NOTCH1 pathway
Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
S37 mutants of beta-catenin aren't phosphorylated pathway
AXIN missense mutants destabilize the destruction complex pathway
TCF dependent signaling in response to WNT pathway
SMAD2/3 MH2 Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants in Cancer pathway
FBXW7 Mutants and NOTCH1 in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants in Cancer pathway
TGFBR2 Kinase Domain Mutants in Cancer pathway
APC truncation mutants are not K63 polyubiquitinated pathway
S45 mutants of beta-catenin aren't phosphorylated pathway
Mitotic G1-G1/S phases pathway
misspliced GSK3beta mutants stabilize beta-catenin pathway
TCF7L2 mutants don't bind CTBP pathway
Signalling by NGF pathway
Gene Expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
truncations of AMER1 destabilize the destruction complex pathway
Loss of Function of TGFBR1 in Cancer pathway
NOTCH1 Intracellular Domain Regulates Transcription pathway
TGFBR2 MSI Frameshift Mutants in Cancer pathway
SMAD4 MH2 Domain Mutants in Cancer pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Signal Transduction pathway
TGFBR1 KD Mutants in Cancer pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
truncated APC mutants destabilize the destruction complex pathway
Transcriptional activity of SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer pathway
HDACs deacetylate histones pathway
Signaling by NOTCH pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
S33 mutants of beta-catenin aren't phosphorylated pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants pathway
Signaling by TGF-beta Receptor Complex pathway
p75NTR negatively regulates cell cycle via SC1 pathway
Loss of Function of SMAD2/3 in Cancer pathway
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
XAV939 inhibits tankyrase, stabilizing AXIN pathway
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KEGG |
Notch signaling pathway pathway
Cell cycle pathway
Chronic myeloid leukemia pathway
Huntington's disease pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH |
TGF-beta signaling pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.202504 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008228 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS18696 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||