Mus musculus Gene: Rag1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-193190.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rag1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | recombination activating gene 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Rag-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000061311 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
recombination activating gene 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Rag1 knockout mice display deficient early inflammatory responses and reduced survival during sepsis, which demonstrates a novel role of B cells in the early innate immune response.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] Rag1 knockout mice display deficient early inflammatory responses and reduced survival during sepsis, which demonstrates a novel role of B cells in the early innate immune response. (Demonstrated in mice)
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000166349:
The protein encoded by this gene is involved in activation of immunoglobulin V-D-J recombination. The encoded protein is involved in recognition of the DNA substrate, but stable binding and cleavage activity also requires RAG2. Defects in this gene can be the cause of several diseases. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:101638282-101649501 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | E2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 22 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 16 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Primary immunodeficiency pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Primary immunodeficiency pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P15919 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q6XC89 Q8C2F3 Q8C2U3 Q99NN8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 19373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.828 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009019 XM_006499012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS16463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:97848 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rag1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK087946 AK088725 AL929569 AY011883 AY241462 BC138342 CH466519 M29475 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA40028 AAG38401 AAI38343 AAP76401 BAC40054 BAC40529 CAM20888 EDL27655 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 19373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||