Mus musculus Gene: Kars | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-193865.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Kars | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | lysyl-tRNA synthetase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AA589550; AL024334; AL033315; AL033367; D8Ertd698e; D8Wsu108e; LysRS; mKIAA0070 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000031948 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lysyl-tRNA synthetase
lysyl-tRNA synthetase
lysyl-tRNA synthetase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000065427:
Aminoacyl-tRNA synthetases are a class of enzymes that charge tRNAs with their cognate amino acids. Lysyl-tRNA synthetase is a homodimer localized to the cytoplasm which belongs to the class II family of tRNA synthetases. It has been shown to be a target of autoantibodies in the human autoimmune diseases, polymyositis or dermatomyositis. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:111993440-112011323 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 44 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Aminoacyl-tRNA biosynthesis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Mitochondrial tRNA aminoacylation pathway
Cytosolic tRNA aminoacylation pathway
tRNA Aminoacylation pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Aminoacyl-tRNA biosynthesis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8CFK5 Q8R2P8 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 85305 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.196544 Mm.415281 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001286384 XM_006531519 NM_001130868 NM_053092 XM_006544333 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS52677 CCDS40481 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1934754 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Kars | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC114648 BC027356 BC035324 CH466525 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH27356 AAH35324 EDL11524 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 102641648 85305 | ||||||||||||||||||||||