Mus musculus Gene: Suds3 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-194701.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Suds3 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | suppressor of defective silencing 3 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2400003N08Rik; 2410008L21Rik; AU067672; mSds3 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000066900 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
suppressor of defective silencing 3 homolog (S. cerevisiae)
suppressor of defective silencing 3 homolog (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000111707:
SDS3 is a subunit of the histone deacetylase (see HDAC1; MIM 601241)-dependent SIN3A (MIM 607776) corepressor complex (Fleischer et al., 2003 [PubMed 12724404]).[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:117091682-117115993 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 12 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
HDACs deacetylate histones pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Epigenetic regulation of gene expression pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
HDACs deacetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Gene Expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
Gene Expression pathway
Chromatin organization pathway
HDACs deacetylate histones pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8BR65 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 71954 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.34456 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001122666 NM_178622 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS51631 CCDS39232 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1919204 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Suds3 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AF469109 AK043652 AK045475 AK138947 AK150633 BC055764 BC062176 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH55764 AAH62176 AAM22676 BAC31608 BAC32387 BAE23831 BAE29722 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 71954 | ||||||||||||||||||||||