Mus musculus Gene: Irf8 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-196509.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Irf8 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | interferon regulatory factor 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI893568; ICSBP; Icsbp1; IRF-8; Myls | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000041515 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
interferon regulatory factor 8
interferon regulatory factor 8
interferon regulatory factor 8
interferon regulatory factor 8
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
De-SUMOylation of IRF8 at residue Lys310 acts as a molecular mechanism to trigger innate immune responses in activated macrophages.
Irf8-Ifng circuit is a novel gastric innate immune mechanism in the host defense against infection with Helicobacter pylori.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] IRF8 interacts with TRAF6 to modulate TLR signalling and may also contribute to the cross-talk between IFN-gamma and TLR signalling pathways.
[Homo sapiens] IRF8 belongs to a family of interferon (IFN) regulatory factors that modulate various important physiologic processes including host defence, cell growth and differentiation and immune regulation.
[Homo sapiens] De-SUMOylation of IRF8 at residue Lys310 acts as a molecular mechanism to trigger innate immune responses in activated macrophages. (Demonstrated in mice)
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a transcription factor that belongs to the interferon regulatory factor family. Proteins belonging to this family have a DNA binding domain at the amino terminus that contains five well-conserved tryptophan-rich repeats. This domain recognizes DNA sequences similar to the interferon-stimulated response element. The protein encoded by this gene promotes or suppresses lineage-specific genes to regulate the differentation of lymphoid and myeloid lineage cells. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:120736358-120756694 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | E1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 337 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 70 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Immune System pathway
Interferon gamma signaling pathway
Interferon Signaling pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interferon alpha/beta signaling pathway
Interferon gamma signaling pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Interferon Signaling pathway
Immune System pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated targets of C-MYC transcriptional repression
GMCSF-mediated signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E0CZE4 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 15900 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.334861 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008320 XM_006530704 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22721 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:96395 | ||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Irf8 | ||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC114819 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 15900 | ||||||||||||||||||||||||||||||