Mus musculus Gene: Runx3 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-196773.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Runx3 | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | runt related transcription factor 3 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AML2; Cbfa3; Pebp2a3 | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000070691 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
runt related transcription factor 3
runt related transcription factor 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] RUNX3 is capable of activating the CD11a gene promoter that directs CD11a/CD18 integrin expression as well as trans-activating the CD49d gene promoter. The leukocyte integrins CD11a/CD18 (LFA-1, alphaLbeta2) and CD49d (VLA-4, alpha4beta1, alpha4beta7) mediate leukocyte transendothelial migration during immune and inflammatory responses and provide co-stimulatory signals for the activation of T lymphocytes.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000020633:
This gene encodes a member of the runt domain-containing family of transcription factors. A heterodimer of this protein and a beta subunit forms a complex that binds to the core DNA sequence 5'-PYGPYGGT-3' found in a number of enhancers and promoters, and can either activate or suppress transcription. It also interacts with other transcription factors. It functions as a tumor suppressor, and the gene is frequently deleted or transcriptionally silenced in cancer. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a member of the runt domain-containing family of transcription factors. A heterodimer of this protein and a beta subunit forms a complex that binds to the core DNA sequence 5\'-PYGPYGGT-3\' found in a number of enhancers and promoters, and can either activate or suppress transcription. It also interacts with other transcription factors. It functions as a tumor suppressor, and the gene is frequently deleted or transcriptionally silenced in cancer. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:135120652-135177990 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | D3 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 34 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TGF_beta_Receptor pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.378894 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_019732 XM_006537058 XM_006538506 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS18782 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||