Mus musculus Gene: Gtf2b | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-197413.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Gtf2b | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | general transcription factor IIB | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028271 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
general transcription factor IIB
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000137947:
This gene encodes the general transcription factor IIB, one of the ubiquitous factors required for transcription initiation by RNA polymerase II. The protein localizes to the nucleus where it forms a complex (the DAB complex) with transcription factors IID and IIA. Transcription factor IIB serves as a bridge between IID, the factor which initially recognizes the promoter sequence, and RNA polymerase II. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:142765226-142783603 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | H1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 12 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 74 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase II Transcription Initiation And Promoter Clearance pathway
RNA Polymerase II Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase II Promoter Escape pathway
RNA Polymerase II Transcription Pre-Initiation And Promoter Opening pathway
RNA Polymerase II Pre-transcription Events pathway
Gene Expression pathway
RNA Polymerase II Transcription pathway
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KEGG |
Basal transcription factors pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase II Transcription Pre-Initiation And Promoter Opening pathway
RNA Polymerase II Pre-transcription Events pathway
RNA Polymerase II Promoter Escape pathway
RNA Polymerase II Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase II Transcription Initiation And Promoter Clearance pathway
HIV Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase II HIV Promoter Escape pathway
Transcription of the HIV genome pathway
Late Phase of HIV Life Cycle pathway
RNA Polymerase II Transcription pathway
HIV Life Cycle pathway
HIV Infection pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
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KEGG |
Basal transcription factors pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P62915 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3ULN2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 229906 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.271756 Mm.400423 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_145546 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17882 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2385191 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Gtf2b | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK133097 AK145403 AK146223 AK146666 AK146910 AK151577 BC016637 CH466532 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH16637 BAE21509 BAE26416 BAE26991 BAE27344 BAE27522 BAE30517 EDL12044 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 229906 | ||||||||||||||||||||||