Mus musculus Gene: Itgae | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-197618.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Itgae | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | integrin alpha E, epithelial-associated | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | A530055J10; alpha-E1; alpha-M290; aM290; CD103 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000005947 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
integrin alpha E, epithelial-associated
integrin alpha E, epithelial-associated
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000083457:
Integrins are heterodimeric integral membrane proteins composed of an alpha chain and a beta chain. This gene encodes an I-domain-containing alpha integrin that undergoes post-translational cleavage in the extracellular domain, yielding disulfide-linked heavy and light chains. In combination with the beta 7 integrin, this protein forms the E-cadherin binding integrin known as the human mucosal lymphocyte-1 antigen. This protein is preferentially expressed in human intestinal intraepithelial lymphocytes (IEL), and in addition to a role in adhesion, it may serve as an accessory molecule for IEL activation. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:73090583-73147446 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B4 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Extracellular matrix organization pathway
Integrin cell surface interactions pathway
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KEGG |
Regulation of actin cytoskeleton pathway
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INOH |
Integrin signaling pathway pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Integrin cell surface interactions pathway
Extracellular matrix organization pathway
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KEGG |
Regulation of actin cytoskeleton pathway
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INOH |
Integrin signaling pathway pathway
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PID NCI |
E-cadherin signaling in the nascent adherens junction
Integrin family cell surface interactions
AlphaE beta7 integrin cell surface interactions
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.96 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008399 NM_172944 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24995 CCDS24996 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||