Mus musculus Gene: Arntl2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-198494.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Arntl2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000040187 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like 2
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like 2
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like 2
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like 2
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000029153:
This gene encodes a basic helix-loop-helix transcription factor belonging to the PAS (PER, ARNT, SIM) superfamily. The PAS proteins play important roles in adaptation to low atmospheric and cellular oxygen levels, exposure to certain environmental pollutants, and diurnal oscillations in light and temperature. This protein forms a transcriptionally active heterodimer with the circadian CLOCK protein, the structurally related MOP4, and hypoxia-inducible factors, such as HIF1alpha. Consistent with its role as a biologically relevant partner of circadian and hypoxia factors, this protein is coexpressed in regions of the brain such as the thalamus, hypothalamus, and amygdala. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:146796055-146833529 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | G3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Circadian Clock pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q2VPD4 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 272322 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.442075 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_172309 NM_001289679 NM_001289680 XM_006507053 XM_006507054 XM_006536083 XM_006536084 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20702 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2684845 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Arntl2 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AY005163 AY014836 BC108965 BC108966 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF88141 AAI08966 AAI08967 AAK12619 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 272322 | ||||||||||||||||||||||