Mus musculus Gene: Itgb1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-201159.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Itgb1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | integrin beta 1 (fibronectin receptor beta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 4633401G24Rik; AA409975; AA960159; CD29; ENSMUSG00000051907; Fnrb; Gm9863; gpIIa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000025809 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
integrin beta 1 (fibronectin receptor beta)
integrin beta 1 (fibronectin receptor beta)
integrin beta 1 (fibronectin receptor beta)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] ITGB1 along with ITGA3 is a novel regulator for the recognition of bacterial lipopeptides. ITGB1/ITGA3 integrin regulates endosomal Toll-like receptor (TLR)-2/TLR1 signalling, serving as a mechanism for modulating inflammatory responses.
[Homo sapiens] IFNG primes mast cells for enhanced anti-bacterial and pro-inflammatory responses to Staphylococcus aureus, partially mediated by ITGB1.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000150093:
Integrins are heterodimeric proteins made up of alpha and beta subunits. At least 18 alpha and 8 beta subunits have been described in mammals. Integrin family members are membrane receptors involved in cell adhesion and recognition in a variety of processes including embryogenesis, hemostasis, tissue repair, immune response and metastatic diffusion of tumor cells. This gene encodes a beta subunit. Multiple alternatively spliced transcript variants which encode different protein isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:128685654-128733200 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | E2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 46 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 88 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Syndecan interactions pathway
Hemostasis pathway
Fibronectin matrix formation pathway
Elastic fibre formation pathway
Molecules associated with elastic fibres pathway
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Immune System pathway
Extracellular matrix organization pathway
Basigin interactions pathway
Laminin interactions pathway
Platelet Adhesion to exposed collagen pathway
CHL1 interactions pathway
Axon guidance pathway
Integrin cell surface interactions pathway
Cell-extracellular matrix interactions pathway
Signal transduction by L1 pathway
L1CAM interactions pathway
Localization of the PINCH-ILK-PARVIN complex to focal adhesions pathway
Adaptive Immune System pathway
Developmental Biology pathway
ECM proteoglycans pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
Semaphorin interactions pathway
Cell junction organization pathway
Other semaphorin interactions pathway
Cell-Cell communication pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
ECM-receptor interaction pathway
Regulation of actin cytoskeleton pathway
Small cell lung cancer pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Focal adhesion pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Pathways in cancer pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Leishmaniasis pathway
Phagosome pathway
Toxoplasmosis pathway
Bacterial invasion of epithelial cells pathway
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INOH |
Integrin signaling pathway pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
TGF_beta_Receptor pathway
Prolactin pathway
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REACTOME |
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell pathway
Basigin interactions pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Platelet Adhesion to exposed collagen pathway
Integrin cell surface interactions pathway
Molecules associated with elastic fibres pathway
Elastic fibre formation pathway
Fibronectin matrix formation pathway
Localization of the PINCH-ILK-PARVIN complex to focal adhesions pathway
Cell-extracellular matrix interactions pathway
Signal transduction by L1 pathway
CHL1 interactions pathway
L1CAM interactions pathway
Other semaphorin interactions pathway
Developmental Biology pathway
Cell-Cell communication pathway
Extracellular matrix organization pathway
Semaphorin interactions pathway
Cell junction organization pathway
Syndecan interactions pathway
Axon guidance pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
ECM proteoglycans pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
Laminin interactions pathway
Hemostasis pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
Fibronectin matrix formation pathway
Laminin interactions pathway
Extracellular matrix organization pathway
L1CAM interactions pathway
Basigin interactions pathway
Localization of the PINCH-ILK-PARVIN complex to focal adhesions pathway
Hemostasis pathway
Immune System pathway
Molecules associated with elastic fibres pathway
Signal transduction by L1 pathway
Cell junction organization pathway
Elastic fibre formation pathway
Cell-Cell communication pathway
Axon guidance pathway
Integrin cell surface interactions pathway
Platelet Adhesion to exposed collagen pathway
CHL1 interactions pathway
Adaptive Immune System pathway
Cell-extracellular matrix interactions pathway
ECM proteoglycans pathway
Other semaphorin interactions pathway
Syndecan interactions pathway
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell pathway
Semaphorin interactions pathway
Developmental Biology pathway
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KEGG |
Regulation of actin cytoskeleton pathway
Pathogenic Escherichia coli infection pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
ECM-receptor interaction pathway
Axon guidance pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Small cell lung cancer pathway
Focal adhesion pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Pathways in cancer pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Leishmaniasis pathway
Bacterial invasion of epithelial cells pathway
Shigellosis pathway
Toxoplasmosis pathway
Phagosome pathway
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INOH |
Integrin signaling pathway pathway
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PID NCI |
Syndecan-2-mediated signaling events
Beta1 integrin cell surface interactions
Reelin signaling pathway
Integrin family cell surface interactions
VEGFR3 signaling in lymphatic endothelium
Urokinase-type plasminogen activator (uPA) and uPAR-mediated signaling
Alpha9 beta1 integrin signaling events
a6b1 and a6b4 Integrin signaling
Signaling events mediated by focal adhesion kinase
Validated targets of C-MYC transcriptional repression
Angiopoietin receptor Tie2-mediated signaling
Signaling events mediated by TCPTP
Signaling events mediated by PRL
Syndecan-4-mediated signaling events
Alpha4 beta1 integrin signaling events
RhoA signaling pathway
a4b7 Integrin signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 16412 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.263396 Mm.465852 Mm.466307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_010578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:96610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Itgb1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 16412 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||