Mus musculus Gene: Ncf1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-202592.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ncf1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | neutrophil cytosolic factor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
Ncf-1; NCF-47K; NOXO2; p47-phox; p47 |
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Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000015950 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
neutrophil cytosolic factor 1
neutrophil cytosolic factor 1
neutrophil cytosolic factor 1
neutrophil cytosolic factor 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000158517:
The protein encoded by this gene is a 47 kDa cytosolic subunit of neutrophil NADPH oxidase. This oxidase is a multicomponent enzyme that is activated to produce superoxide anion. Mutations in this gene have been associated with chronic granulomatous disease. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:134220053-134229625 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | G2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 40 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Disease pathway
Signaling by VEGF pathway
Phagosomal maturation (early endosomal stage) pathway
Latent infection of Homo sapiens with Mycobacterium tuberculosis pathway
Immune System pathway
VEGFA-VEGFR2 Pathway pathway
Antigen processing-Cross presentation pathway
Cross-presentation of particulate exogenous antigens (phagosomes) pathway
Adaptive Immune System pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG |
Leukocyte transendothelial migration pathway
Fc gamma R-mediated phagocytosis pathway
Chemokine signaling pathway pathway
Leishmaniasis pathway
Osteoclast differentiation pathway
Phagosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
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REACTOME |
Cross-presentation of particulate exogenous antigens (phagosomes) pathway
Phagosomal maturation (early endosomal stage) pathway
Signaling by VEGF pathway
Signal Transduction pathway
Antigen processing-Cross presentation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
VEGFA-VEGFR2 Pathway pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Latent infection of Homo sapiens with Mycobacterium tuberculosis pathway
Disease pathway
Phagosomal maturation (early endosomal stage) pathway
Cross-presentation of particulate exogenous antigens (phagosomes) pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
VEGFA-VEGFR2 Pathway pathway
Immune System pathway
Latent infection of Homo sapiens with Mycobacterium tuberculosis pathway
Signal Transduction pathway
Signaling by VEGF pathway
Adaptive Immune System pathway
Disease pathway
Antigen processing-Cross presentation pathway
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KEGG |
Leukocyte transendothelial migration pathway
Fc gamma R-mediated phagocytosis pathway
Chemokine signaling pathway pathway
Leishmaniasis pathway
Osteoclast differentiation pathway
Phagosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
RAC1 signaling pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F8WH69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 17969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.425296 Mm.452378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001286037 NM_010876 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS71674 CCDS39298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:97283 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ncf1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC093346 AC158379 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 17969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||