Mus musculus Gene: Copa | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-204973.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Copa | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | coatomer protein complex subunit alpha | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AU040324; xenin | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026553 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
coatomer protein complex subunit alpha
coatomer protein complex subunit alpha
coatomer protein complex subunit alpha
coatomer protein complex subunit alpha
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000122218:
In eukaryotic cells, protein transport between the endoplasmic reticulum and Golgi compartments is mediated in part by non-clathrin-coated vesicular coat proteins (COPs). Seven coat proteins have been identified, and they represent subunits of a complex known as coatomer. The subunits are designated alpha-COP, beta-COP, beta-prime-COP, gamma-COP, delta-COP, epsilon-COP, and zeta-COP. The alpha-COP, encoded by COPA, shares high sequence similarity with RET1P, the alpha subunit of the coatomer complex in yeast. Also, the N-terminal 25 amino acids of alpha-COP encode the bioactive peptide, xenin, which stimulates exocrine pancreatic secretion and may act as a gastrointestinal hormone. Alternative splicing results in multiple splice forms encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:172082529-172122330 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | H3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 32 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 37 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Membrane Trafficking pathway
Golgi to ER Retrograde Transport pathway
COPI Mediated Transport pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
COPI Mediated Transport pathway
Golgi to ER Retrograde Transport pathway
Membrane Trafficking pathway
Golgi to ER Retrograde Transport pathway
COPI Mediated Transport pathway
Membrane Trafficking pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Arf1 pathway
C-MYB transcription factor network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.30041 Mm.414112 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009938 XM_006496640 XM_006496641 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS35780 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||