Mus musculus Gene: Taf15 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-205438.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Taf15 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | TAF15 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2610111C21Rik; 68kDa; Taf2n; TAFII68 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000020680 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
TAF15 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor
TAF15 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog null:
This gene encodes a member of the TET family of RNA-binding proteins. The encoded protein plays a role in RNA polymerase II gene transcription as a component of a distinct subset of multi-subunit transcription initiation factor TFIID complexes. Translocations involving this gene play a role in acute leukemia and extraskeletal myxoid chondrosarcoma, and mutations in this gene may play a role in amyotrophic lateral sclerosis. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, May 2012] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:83473086-83506743 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 39 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Basal transcription factors pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Basal transcription factors pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8BQ46 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 70439 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_027427 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS25168 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1917689 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Taf15 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK051568 AK146331 AL596122 AL663096 BC137591 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI37592 BAC34676 BAE27086 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 70439 | ||||||||||||||||||||||