Mus musculus Gene: Rbak | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-207572.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rbak | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | RB-associated KRAB repressor | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000061898 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
RB-associated KRAB repressor
RB-associated KRAB repressor
RB-associated KRAB repressor
RB-associated KRAB repressor
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000146587:
This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring RBAK (RB-associated KRAB zinc finger) and LOC389458 (hypothetical LOC389458) genes on chromosome 7. The read-through transcript encodes a protein that shares sequence identity with the upstream gene product but its C-terminal region is distinct due to frameshifts relative to the downstream gene. [provided by RefSeq, Mar 2011] This gene encodes a nuclear protein which interacts with the tumor suppressor retinoblastoma 1. The two interacting proteins are thought to act as a transcriptional repressor for promoters which are activated by the E2F1 transcription factor. This protein contains a Kruppel-associated box (KRAB), which is a transcriptional repressor motif. Read-through transcripts that include exons from the downstream gene LOC389458 are expressed from this locus. [provided by RefSeq, Mar 2011] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:143172186-143180775 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | G2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
|
||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E9Q1P1 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 57782 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.320419 Mm.401378 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001045482 NM_021326 XM_006504723 XM_006504724 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19835 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1927369 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rbak | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC123686 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 57782 | ||||||||||||||||||||||