Mus musculus Gene: Capn2 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-207731.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Capn2 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | calpain 2 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI326419; Capa-2; Capa2; m-calpain; m-calpin | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026509 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
calpain 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000162909:
The calpains, calcium-activated neutral proteases, are nonlysosomal, intracellular cysteine proteases. The mammalian calpains include ubiquitous, stomach-specific, and muscle-specific proteins. The ubiquitous enzymes consist of heterodimers with distinct large, catalytic subunits associated with a common small, regulatory subunit. This gene encodes the large subunit of the ubiquitous enzyme, calpain 2. Multiple heterogeneous transcriptional start sites in the 5' UTR have been reported. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2009] The calpains, calcium-activated neutral proteases, are nonlysosomal, intracellular cysteine proteases. The mammalian calpains include ubiquitous, stomach-specific, and muscle-specific proteins. The ubiquitous enzymes consist of heterodimers with distinct large, catalytic subunits associated with a common small, regulatory subunit. This gene encodes the large subunit of the ubiquitous enzyme, calpain 2. Multiple heterogeneous transcriptional start sites in the 5\' UTR have been reported. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:182467256-182517495 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | H5 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 10 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 14 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Alzheimer's disease pathway
Apoptosis pathway
Focal adhesion pathway
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Apoptosis pathway
Alzheimer's disease pathway
Focal adhesion pathway
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
ErbB1 downstream signaling
Signaling events mediated by focal adhesion kinase
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O08529 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8R486 Q920R9 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12334 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.19306 Mm.416255 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009794 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS35813 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:88264 | ||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Capn2 | ||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB050199 AF015038 AF497625 BC054726 D38117 Y10139 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB94029 AAH54726 AAM19226 BAA22964 BAB70477 CAA71227 | ||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 12334 | ||||||||||||||||||||||||||