Mus musculus Gene: Nxt1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-208995.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Nxt1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | NTF2-related export protein 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1110001N02Rik | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000036992 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
NTF2-related export protein 1
NTF2-related export protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000132661:
The protein encoded by this gene is located in the nuclear envelope. It has protein similarity to nuclear transport factor 2. This protein functions as a nuclear export factor in both RAN (Ras-related nuclear protein)- and CRM1 (required for chromosome region maintenance)-dependent pathways. It is found to stimulate the export of U1 snRNA in RAN- and CRM1-dependent pathways and the export of tRNA and mRNA in a CRM1-independent pathway. The encoded protein heterodimerizes with Tap protein and may regulate the ability of Tap protein to mediate nuclear mRNA export. The use of alternate polyadenylation sites has been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:148672601-148676027 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | G3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
RNA transport pathway
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
RNA transport pathway
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9QZV9 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 56488 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.34663 Mm.365392 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001110159 NM_019761 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS16840 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1929619 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Nxt1 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AF156958 AK003254 AK168314 BC023672 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD54943 AAH23672 BAB22670 BAE40254 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 56488 | ||||||||||||||||||||||