Mus musculus Gene: Cst3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-209151.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cst3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cystatin C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CysC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027447 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cystatin C
cystatin C
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000101439:
The cystatin superfamily encompasses proteins that contain multiple cystatin-like sequences. Some of the members are active cysteine protease inhibitors, while others have lost or perhaps never acquired this inhibitory activity. There are three inhibitory families in the superfamily, including the type 1 cystatins (stefins), type 2 cystatins and the kininogens. The type 2 cystatin proteins are a class of cysteine proteinase inhibitors found in a variety of human fluids and secretions, where they appear to provide protective functions. The cystatin locus on chromosome 20 contains the majority of the type 2 cystatin genes and pseudogenes. This gene is located in the cystatin locus and encodes the most abundant extracellular inhibitor of cysteine proteases, which is found in high concentrations in biological fluids and is expressed in virtually all organs of the body. A mutation in this gene has been associated with amyloid angiopathy. Expression of this protein in vascular wall smooth muscle cells is severely reduced in both atherosclerotic and aneurysmal aortic lesions, establishing its role in vascular disease. [provided by RefSeq, Jul 2008] The cystatin superfamily encompasses proteins that contain multiple cystatin-like sequences. Some of the members are active cysteine protease inhibitors, while others have lost or perhaps never acquired this inhibitory activity. There are three inhibitory families in the superfamily, including the type 1 cystatins (stefins), type 2 cystatins and the kininogens. The type 2 cystatin proteins are a class of cysteine proteinase inhibitors found in a variety of human fluids and secretions, where they appear to provide protective functions. The cystatin locus on chromosome 20 contains the majority of the type 2 cystatin genes and pseudogenes. This gene is located in the cystatin locus and encodes the most abundant extracellular inhibitor of cysteine proteases, which is found in high concentrations in biological fluids and is expressed in virtually all organs of the body. A mutation in this gene has been associated with amyloid angiopathy. Expression of this protein in vascular wall smooth muscle cells is severely reduced in both atherosclerotic and aneurysmal aortic lesions, establishing its role in vascular disease. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding a single protein. [provided by RefSeq, Dec 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:148871722-148875692 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | G3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Disease pathway
Amyloids pathway
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KEGG |
Salivary secretion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Amyloids pathway
Disease pathway
Amyloids pathway
Disease pathway
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KEGG |
Salivary secretion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P21460 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A2APX3 Q3U5K7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 13010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.396690 Mm.469035 Mm.486105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009976 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS16852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:102519 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Cst3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF483486 AF483487 AK002438 AK013676 AK014368 AK131728 AK146333 AK151160 AK153533 AK161856 AK166430 AL844519 BC002072 M59470 U10098 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA63298 AAB41056 AAH02072 AAL90760 AAL90761 BAB22101 BAB28949 BAB29303 BAE20785 BAE27088 BAE30165 BAE32071 BAE36608 BAE38771 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 13010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||