Mus musculus Gene: Dnmt3b | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-210140.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Dnmt3b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | DNA methyltransferase 3B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | MmuIIIB | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027478 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
DNA methyltransferase 3B
DNA methyltransferase 3B
DNA methyltransferase 3B
DNA methyltransferase 3B
DNA methyltransferase 3B
DNA methyltransferase 3B
DNA methyltransferase 3B
DNA methyltransferase 3B
DNA methyltransferase 3B
DNA methyltransferase 3B
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This is one of two related genes encoding de novo DNA methyltransferases, which are responsible for the establishment of DNA methylation patterns in embryos. Loss of function of this gene results in severe developmental defects and loss of viability. Mutation of the related gene in humans causes immunodeficiency-centromeric instability-facial anomalies (ICF) syndrome. There is a pseudogene for this gene located adjacent to this gene in the same region of chromosome 2. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed. [provided by RefSeq, Nov 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:153649450-153687730 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | H1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 25 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 74 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Mus musculus biological processes pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
PRC2 methylates histones and DNA pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
Gene Expression pathway
DNA methylation pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
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KEGG |
Cysteine and methionine metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PRC2 methylates histones and DNA pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
DNA methylation pathway
Gene Expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
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KEGG |
Cysteine and methionine metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.398574 Mm.89772 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001003960 NM_001003961 NM_001003963 NM_001122997 NM_001271744 NM_001271745 NM_001271746 NM_001271747 NM_010068 XM_006498682 XM_006498683 XM_006498684 XM_006498685 XM_006498686 XM_006498687 XM_006498688 XM_006498689 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS16913 CCDS16914 CCDS16915 CCDS16916 CCDS50759 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||