Mus musculus Gene: Cebpb | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-213090.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cebpb | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), beta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | C/EBPbeta; CRP2; IL-6DBP; LAP; LIP; NF-IL6; NF-M; Nfil6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000056501 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), beta
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Cebpb is a member of the CCAAT enhancer binding protein family and is a transcriptional factor regulating genes in innate immunity and inflammation. The activities of CEBP are regulated via methylation of arginine and lysine side chains.
LPS stimulation promotes the formation of CEBPB complexes on the Serpinb2 promoter to drive transcription.
Tnfaip3 is regulated by both Nf-κB and p38-dependent Cebpb in response to LPS in macrophages.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] CEBPB, one of the CEBP family members, is a crucial regulator of gene expression during innate immunity, inflammatory responses and adipogenesis. All of the individual CEBPB isoforms, LAP1, LAP2 and LIP, attenuate EGF-induced PTGS2 (COX-2) promoter activity.
[Homo sapiens] CEBPB is a member of the CCAAT enhancer binding protein family and is a transcriptional factor regulating genes in innate immunity and inflammation. The activities of CEBP are regulated via methylation of arginine and lysine side chains.
[Homo sapiens] CREB1 and CEBPB are involved in cytokine production in neutrophils in response to LPS and TNF.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000172216:
The protein encoded by this intronless gene is a bZIP transcription factor which can bind as a homodimer to certain DNA regulatory regions. It can also form heterodimers with the related proteins CEBP-alpha, CEBP-delta, and CEBP-gamma. The encoded protein is important in the regulation of genes involved in immune and inflammatory responses and has been shown to bind to the IL-1 response element in the IL-6 gene, as well as to regulatory regions of several acute-phase and cytokine genes. In addition, the encoded protein can bind the promoter and upstream element and stimulate the expression of the collagen type I gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] This intronless gene encodes a transcription factor that contains a basic leucine zipper (bZIP) domain. The encoded protein functions as a homodimer but can also form heterodimers with CCAAT/enhancer-binding proteins alpha, delta, and gamma. Activity of this protein is important in the regulation of genes involved in immune and inflammatory responses, among other processes. The use of alternative in-frame AUG start codons results in multiple protein isoforms, each with distinct biological functions. [provided by RefSeq, Oct 2013] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:167688915-167690418 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | H3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 71 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 113 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Transcriptional Regulation of Adipocyte Differentiation in 3T3-L1 Pre-adipocytes pathway
Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation pathway
Mus musculus biological processes pathway
Cellular responses to stress pathway
Cellular Senescence pathway
Senescence-Associated Secretory Phenotype (SASP) pathway
Developmental Biology pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
TCR pathway
IL4 pathway
IL6 pathway
RANKL pathway
Oncostatin_M pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation pathway
Cellular responses to stress pathway
Developmental Biology pathway
Cellular Senescence pathway
Senescence-Associated Secretory Phenotype (SASP) pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated nuclear estrogen receptor alpha network
C-MYB transcription factor network
IL4-mediated signaling events
Regulation of nuclear SMAD2/3 signaling
Signaling mediated by p38-alpha and p38-beta
IL3-mediated signaling events
FOXA1 transcription factor network
IL6-mediated signaling events
IFN-gamma pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.439656 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001287738 NM_001287739 NM_009883 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||