Mus musculus Gene: Stx16 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-213413.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Stx16 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | syntaxin 16 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027522 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
syntaxin 16
syntaxin 16
syntaxin 16
syntaxin 16
syntaxin 16
syntaxin 16
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000124222:
This gene encodes a protein that is a member of the syntaxin or t-SNARE (target-SNAP receptor) family. These proteins are found on cell membranes and serve as the targets for V-SNARES (vesicle-SNAP receptors) permitting specific synaptic vesicle docking and fusion. A microdeletion in the region of chromosome 20 where this gene is located has been associated with pseudohypoparathyroidism type Ib. Multiple transcript variants have been found for this gene. Read-through transcription also exists between this gene and the neighboring downstream aminopeptidase-like 1 (NPEPL1) gene. [provided by RefSeq, Mar 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:174076308-174099771 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | H4 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
SNARE interactions in vesicular transport pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
SNARE interactions in vesicular transport pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B7ZCB8 B7ZCB9 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 228960 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.399871 Mm.487977 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001102423 NM_001102424 NM_001102425 NM_172675 XM_006499435 XM_006499436 XM_006499437 XM_006499438 XM_006499439 XM_006499440 XM_006499441 XM_006499442 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17147 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1923396 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Stx16 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AL669896 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 228960 | ||||||||||||||||||||||