Mus musculus Gene: Gata5 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-213820.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Gata5 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | GATA binding protein 5 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000015627 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
GATA binding protein 5
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000130700:
The protein encoded by this gene is a transcription factor that contains two GATA-type zinc fingers. The encoded protein is known to bind to hepatocyte nuclear factor-1alpha (HNF-1alpha), and this interaction is essential for cooperative activation of the intestinal lactase-phlorizin hydrolase promoter. In other organisms, similar proteins may be involved in the establishment of cardiac smooth muscle cell diversity. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:180325133-180334699 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | H4 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Hemostasis pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
Hemostasis pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
Hemostasis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P97489 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q0VGI9 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 14464 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.388880 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008093 XM_006500554 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17175 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:109497 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Gata5 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK132020 AK142213 AL663027 BC105654 CH466626 U84725 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB47506 AAI05655 BAE20945 BAE24979 CAM16220 EDL07330 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 14464 | ||||||||||||||||||||||