Mus musculus Gene: Prpf6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-214170.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Prpf6 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | PRP6 pre-mRNA splicing factor 6 homolog (yeast) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1190003A07Rik; 2610031L17Rik; ANT-1; U5-102K | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000002455 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PRP6 pre-mRNA splicing factor 6 homolog (yeast)
PRP6 pre-mRNA splicing factor 6 homolog (yeast)
PRP6 pre-mRNA splicing factor 6 homolog (yeast)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000101161:
The protein encoded by this gene appears to be involved in pre-mRNA splicing, possibly acting as a bridging factor between U5 and U4/U6 snRNPs in formation of the spliceosome. The encoded protein also can bind androgen receptor, providing a link between transcriptional activation and splicing. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:181591868-181655660 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | H4 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 63 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Gene Expression pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.292001 Mm.418200 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_133701 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38381 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||