Homo sapiens Gene: RNF125 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-2177.7 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | RNF125 | ||||||||||||||||||
Gene Name | ring finger protein 125, E3 ubiquitin protein ligase | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000101695 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ring finger protein 125
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||
Summary |
RNF125 is an ubiquitin ligase which negatively regulates RIG-I signalling by conjugating ubiquitin to DDX58 and MDA5 and IPS1, tagging them for proteosomal degradation
RNF125 is inhibited by human Bocavirus protein, VP2, to induce the IFNB signalling pathway.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a novel E3 ubiquitin ligase that contains a RING finger domain in the N-terminus and three zinc-binding and one ubiquitin-interacting motif in the C-terminus. As a result of myristoylation, this protein associates with membranes and is primarily localized to intracellular membrane systems. The encoded protein may function as a positive regulator in the T-cell receptor signaling pathway. [provided by RefSeq, Mar 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:32018372-32073213 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q12.1 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 33 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
Innate Immune System pathway
Immune System pathway
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KEGG |
RIG-I-like receptor signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.633703 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_017831 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11902 | ||||||||||||||||||
HPRD | 11500 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||