Homo sapiens Gene: SDCBP | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-22706.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SDCBP | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | syndecan binding protein (syntenin) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | MDA-9; MDA9; ST1; SYCL; TACIP18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000137575 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
syndecan binding protein (syntenin)
syndecan binding protein (syntenin)
syndecan binding protein (syntenin)
syndecan binding protein (syntenin)
syndecan binding protein (syntenin)
syndecan binding protein (syntenin)
syndecan binding protein (syntenin)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene was initially identified as a molecule linking syndecan-mediated signaling to the cytoskeleton. The syntenin protein contains tandemly repeated PDZ domains that bind the cytoplasmic, C-terminal domains of a variety of transmembrane proteins. This protein may also affect cytoskeletal-membrane organization, cell adhesion, protein trafficking, and the activation of transcription factors. The protein is primarily localized to membrane-associated adherens junctions and focal adhesions but is also found at the endoplasmic reticulum and nucleus. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:58552924-58582860 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q12.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 53 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
TCR pathway
IL5 pathway
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REACTOME |
Neurofascin interactions pathway
L1CAM interactions pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
Ephrin signaling pathway
EPH-Ephrin signaling pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Syndecan-2-mediated signaling events
Syndecan-4-mediated signaling events
Syndecan-1-mediated signaling events
IL5-mediated signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.200804 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001007067 NM_001007068 NM_001007069 NM_001007070 NM_005625 XM_005251280 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS47862 CCDS47863 CCDS6172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03741 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||