Homo sapiens Gene: SLC4A4 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-22865.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SLC4A4 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | solute carrier family 4, sodium bicarbonate cotransporter, member 4 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | hhNMC; HNBC1; KNBC; NBC1; NBC2; NBCe1-A; pNBC; SLC4A5 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000080493 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
solute carrier family 4, sodium bicarbonate cotransporter, member 4
solute carrier family 4, sodium bicarbonate cotransporter, member 4
solute carrier family 4, sodium bicarbonate cotransporter, member 4
solute carrier family 4, sodium bicarbonate cotransporter, member 4
solute carrier family 4, sodium bicarbonate cotransporter, member 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a sodium bicarbonate cotransporter (NBC) involved in the regulation of bicarbonate secretion and absorption and intracellular pH. Mutations in this gene are associated with proximal renal tubular acidosis. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:71187286-71572087 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q13.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Bicarbonate transporters pathway
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
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KEGG |
Proximal tubule bicarbonate reclamation pathway
Pancreatic secretion pathway
Bile secretion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9Y6R1 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A0A024RD97 A5JJ20 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 8671 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.5462 Hs.592708 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001098484 NM_001134742 NM_003759 XM_005265704 XM_006714398 XM_006714399 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11030 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 603345 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3549 CCDS43236 CCDS47071 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB470072 AC019089 AC079230 AC096713 AC110783 AC112226 AF007216 AF011390 AF053753 AF053754 AF069510 AF157492 AF310248 BC030977 CH471057 EF531618 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC39840 AAC51645 AAD42020 AAF21718 AAF21719 AAF80343 AAG47773 AAH30977 ABQ43327 BAH58226 EAX05642 EAX05643 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 8671 | ||||||||||||||||||||||