Homo sapiens Gene: ITGA1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-236376.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ITGA1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | integrin, alpha 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CD49a; VLA1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000213949 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
integrin, alpha 1
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes the alpha 1 subunit of integrin receptors. This protein heterodimerizes with the beta 1 subunit to form a cell-surface receptor for collagen and laminin. The heterodimeric receptor is involved in cell-cell adhesion and may play a role in inflammation and fibrosis. The alpha 1 subunit contains an inserted (I) von Willebrand factor type I domain which is thought to be involved in collagen binding. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:52787896-52959210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q11.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 17 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Platelet Adhesion to exposed collagen pathway
Integrin cell surface interactions pathway
CHL1 interactions pathway
L1CAM interactions pathway
Other semaphorin interactions pathway
Smooth Muscle Contraction pathway
Developmental Biology pathway
Extracellular matrix organization pathway
Semaphorin interactions pathway
Axon guidance pathway
Laminin interactions pathway
Muscle contraction pathway
Hemostasis pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Regulation of actin cytoskeleton pathway
Hematopoietic cell lineage pathway
ECM-receptor interaction pathway
Focal adhesion pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH |
Integrin signaling pathway pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Beta1 integrin cell surface interactions
Integrin family cell surface interactions
VEGFR3 signaling in lymphatic endothelium
Signaling events mediated by TCPTP
Signaling events mediated by PRL
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.623251 Hs.644352 Hs.679627 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_181501 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01892 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||