Homo sapiens Gene: AFP | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-23783.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | AFP | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | alpha-fetoprotein | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AFPD; FETA; HPAFP | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000081051 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
alpha-fetoprotein
alpha-fetoprotein
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes alpha-fetoprotein, a major plasma protein produced by the yolk sac and the liver during fetal life. Alpha-fetoprotein expression in adults is often associated with hepatoma or teratoma. However, hereditary persistance of alpha-fetoprotein may also be found in individuals with no obvious pathology. The protein is thought to be the fetal counterpart of serum albumin, and the alpha-fetoprotein and albumin genes are present in tandem in the same transcriptional orientation on chromosome 4. Alpha-fetoprotein is found in monomeric as well as dimeric and trimeric forms, and binds copper, nickel, fatty acids and bilirubin. The level of alpha-fetoprotein in amniotic fluid is used to measure renal loss of protein to screen for spina bifida and anencephaly. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:73431138-73456174 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q13.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 14 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
FOXA2 and FOXA3 transcription factor networks
Direct p53 effectors
Glucocorticoid receptor regulatory network
p73 transcription factor network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P02771 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 174 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.518808 Hs.707532 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001134 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:317 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 104150 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3556 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 00074 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK314817 BC027881 M10949 M10950 M16110 V01514 Z19532 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA51674 AAA51675 AAB58754 AAH27881 BAG37340 CAA24758 CAA79592 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 174 | ||||||||||||||||||||||