Homo sapiens Gene: GABARAP | |||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-23900.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | GABARAP | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | GABA(A) receptor-associated protein | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ATG8A; GABARAP-a; MM46 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000170296 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
GABA(A) receptor-associated protein
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Gabarap deficient mice are more susceptible to sepsis due to enhanced inflammasome activation.
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Gamma-aminobutyric acid A receptors [GABA(A) receptors] are ligand-gated chloride channels that mediate inhibitory neurotransmission. This gene encodes GABA(A) receptor-associated protein, which is highly positively charged in its N-terminus and shares sequence similarity with light chain-3 of microtubule-associated proteins 1A and 1B. This protein clusters neurotransmitter receptors by mediating interaction with the cytoskeleton. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:7240014-7242770 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 69 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Regulation of autophagy pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_007278 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11092 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05496 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||