Homo sapiens Gene: NUP62 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-246910.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NUP62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | nucleoporin 62kDa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | IBSN; p62; SNDI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000213024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nucleoporin 62kDa
nucleoporin 62kDa
nucleoporin 62kDa
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The nuclear pore complex is a massive structure that extends across the nuclear envelope, forming a gateway that regulates the flow of macromolecules between the nucleus and the cytoplasm. Nucleoporins are the main components of the nuclear pore complex in eukaryotic cells. The protein encoded by this gene is a member of the FG-repeat containing nucleoporins and is localized to the nuclear pore central plug. This protein associates with the importin alpha/beta complex which is involved in the import of proteins containing nuclear localization signals. Multiple transcript variants of this gene encode a single protein isoform. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:49906825-49929763 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q13.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 81 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
ISG15 antiviral mechanism pathway
Regulation of Glucokinase by Glucokinase Regulatory Protein pathway
Glucose transport pathway
Hexose transport pathway
Nuclear import of Rev protein pathway
Vpr-mediated nuclear import of PICs pathway
Rev-mediated nuclear export of HIV RNA pathway
Viral Messenger RNA Synthesis pathway
Late Phase of HIV Life Cycle pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Influenza Infection pathway
Interactions of Vpr with host cellular proteins pathway
Myoclonic epilepsy of Lafora pathway
Antiviral mechanism by IFN-stimulated genes pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Metabolism of carbohydrates pathway
Transcriptional regulation by small RNAs pathway
Nuclear Pore Complex (NPC) Disassembly pathway
Influenza Viral RNA Transcription and Replication pathway
Interferon Signaling pathway
Cell Cycle pathway
Immune System pathway
M Phase pathway
HIV Life Cycle pathway
Mitotic Prophase pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
HIV Infection pathway
Influenza Life Cycle pathway
Metabolism pathway
Host Interactions of HIV factors pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
Interactions of Rev with host cellular proteins pathway
Gene Expression pathway
Nuclear Envelope Breakdown pathway
Disease pathway
Glycogen storage diseases pathway
Regulatory RNA pathways pathway
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KEGG |
RNA transport pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.638197 Hs.733386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001193357 NM_012346 NM_016553 NM_153718 NM_153719 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12788 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05782 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||