Version 5.4
| Mus musculus Gene: Rpl39 | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-250096.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | Rpl39 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | ribosomal protein L39 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | 2810465O16Rik | ||||||||||||||||||
| Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSMUSG00000079641 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
ribosomal protein L39
|
||||||||||||||||||
| Protein Structure |
|
||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary | Currently no Entrez Summary Available. You might want to check the Summary Sections of the Orthologs. | ||||||||||||||||||
| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome X:37082520-37085402 | ||||||||||||||||||
| Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
| Band | A3.3 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
|
||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
| Biological Process |
|
||||||||||||||||||
| Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
| Orthologs | |||||||||||||||||||
| No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||
| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME |
Peptide chain elongation pathway
Translation pathway
Eukaryotic Translation Termination pathway
Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway
Metabolism of proteins pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) pathway
Cap-dependent Translation Initiation pathway
Eukaryotic Translation Initiation pathway
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane pathway
Eukaryotic Translation Elongation pathway
Formation of a pool of free 40S subunits pathway
Gene Expression pathway
L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression pathway
GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit pathway
|
||||||||||||||||||
| KEGG |
Ribosome pathway
|
||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | P62892 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | Q505A8 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 67248 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.440956 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_026055 XM_006525246 XM_006529004 XM_006543396 XM_006544616 | ||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS40927 | ||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| MGI ID | MGI:1914498 | ||||||||||||||||||
| MGI Symbol | Rpl39 | ||||||||||||||||||
| EMBL | AK002591 AK005511 AK007821 AK008853 AK013381 AK028139 AK088761 AK146772 AK150955 AK168773 BC039092 BC094645 BC139247 BC139249 CH466550 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAH39092 AAH94645 AAI39248 AAI39250 BAB22212 BAB24090 BAB25284 BAB25930 BAB28820 BAC25767 BAC40552 BAE27421 BAE29987 BAE40609 EDL03959 | ||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 102634812 102635960 102642263 67248 | ||||||||||||||||||