Mus musculus Gene: Prnp | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-260830.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Prnp | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | prion protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
AA960666; AI325101; CD230; Prn-i; Prn-p; PrP; PrP |
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Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000079037 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
prion protein
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000171867:
The protein encoded by this gene is a membrane glycosylphosphatidylinositol-anchored glycoprotein that tends to aggregate into rod-like structures. The encoded protein contains a highly unstable region of five tandem octapeptide repeats. This gene is found on chromosome 20, approximately 20 kbp upstream of a gene which encodes a biochemically and structurally similar protein to the one encoded by this gene. Mutations in the repeat region as well as elsewhere in this gene have been associated with Creutzfeldt-Jakob disease, fatal familial insomnia, Gerstmann-Straussler disease, Huntington disease-like 1, and kuru. An overlapping open reading frame has been found for this gene that encodes a smaller, structurally unrelated protein, AltPrp. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:131909928-131938429 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | F2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 55 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 59 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
NCAM1 interactions pathway
Axon guidance pathway
Developmental Biology pathway
NCAM signaling for neurite out-growth pathway
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KEGG |
Prion diseases pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
NCAM1 interactions pathway
NCAM signaling for neurite out-growth pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
NCAM signaling for neurite out-growth pathway
NCAM1 interactions pathway
Axon guidance pathway
Developmental Biology pathway
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KEGG |
Prion diseases pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Glypican 1 network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.648 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001278256 NM_011170 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS16766 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||