Mus musculus Gene: Casc3 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-266574.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Casc3 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | cancer susceptibility candidate 3 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000078676 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cancer susceptibility candidate 3
cancer susceptibility candidate 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000108349:
The product of this gene is a core component of the exon junction complex (EJC), a protein complex that is deposited on spliced mRNAs at exon-exon junctions and functions in nonsense-mediated mRNA decay (NMD). The encoded protein binds RNA and interacts with two other EJC core components. It is predominantly located in the cytoplasm, but shuttles into the nucleus where it localizes to nuclear speckles. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:98804905-98833814 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 13 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
RNA transport pathway
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) pathway
Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway
Gene Expression pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) pathway
Gene Expression pathway
Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway
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KEGG |
RNA transport pathway
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8K3W3 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 192160 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.40120 Mm.409368 Mm.451896 Mm.472400 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_138660 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36302 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2179723 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Casc3 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AF526276 AJ292072 AK139608 AL590963 BC034533 BC060672 BC141296 CH466556 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH34533 AAH60672 AAI41297 AAM88396 BAE24081 CAC27775 CAM46181 EDL16170 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 192160 | ||||||||||||||||||||||