Homo sapiens Gene: NKX6-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-27904.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NKX6-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | NK6 homeobox 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | NKX6.1; NKX6A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000163623 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
NK6 homeobox 1
NK6 homeobox 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
In the pancreas, NKX6.1 is required for the development of beta cells and is a potent bifunctional transcription regulator that binds to AT-rich sequences within the promoter region of target genes Iype et al. (2004) [PubMed 15056733].[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:84491987-84498450 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q21.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Regulation of gene expression in beta cells pathway
Regulation of gene expression in early pancreatic precursor cells pathway
Developmental Biology pathway
Regulation of beta-cell development pathway
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KEGG |
Maturity onset diabetes of the young pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P78426 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F8VWZ9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 4825 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.347185 Hs.623938 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_006168 XM_006714230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:7839 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 602563 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3607 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC096766 U66797 U66798 U66799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD11962 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 4825 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||