Homo sapiens Gene: RUNX1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-2825.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RUNX1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | runt-related transcription factor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AML1; AML1-EVI-1; AMLCR1; CBFA2; EVI-1; PEBP2aB | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000159216 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
runt-related transcription factor 1
runt-related transcription factor 1
runt-related transcription factor 1
runt-related transcription factor 1
runt-related transcription factor 1
runt-related transcription factor 1
runt-related transcription factor 1
runt-related transcription factor 1
runt-related transcription factor 1
runt-related transcription factor 1
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Core binding factor (CBF) is a heterodimeric transcription factor that binds to the core element of many enhancers and promoters. The protein encoded by this gene represents the alpha subunit of CBF and is thought to be involved in the development of normal hematopoiesis. Chromosomal translocations involving this gene are well-documented and have been associated with several types of leukemia. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 21:34787801-36004667 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q22.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 120 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 42 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
TGF_beta_Receptor pathway
RANKL pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Acute myeloid leukemia pathway
Chronic myeloid leukemia pathway
Pathways in cancer pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated transcriptional targets of deltaNp63 isoforms
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q01196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | V9GYT5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 861 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.149261 Hs.536609 Hs.589909 Hs.610169 Hs.617234 Hs.717697 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001754 XM_005261068 NM_001001890 NM_001122607 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10471 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 151385 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13639 CCDS42922 CCDS46646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF015262 AF015720 AF015721 AF015722 AF015723 AF015724 AF015725 AF015726 AF020800 AF020801 AF020802 AF020803 AF022141 AF022794 AF025841 AF027207 AF051934 AF129107 AF129108 AJ229043 AP000330 AP000331 AP000332 AP000333 AP000334 AP000687 AP000688 BC136380 BC136381 BC144053 CH471079 D10570 D13979 D14822 D14823 D43967 D43968 D43969 D89788 D89789 D89790 L21756 L34598 S50186 S60998 S69002 S74092 S76345 S76346 S76350 S78158 S78159 S78496 U19601 X79549 X90976 X90979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA03086 AAA51720 AAB29907 AAB33729 AAB33730 AAB33731 AAB34819 AAB34820 AAB51691 AAC05246 AAC05247 AAI36381 AAI36382 AAI44054 BAA01426 BAA03089 BAA03559 BAA03560 BAA07902 BAA07903 BAA07904 BAA14020 BAA14021 BAA14022 CAA13070 CAA56092 CAA62464 CAA62466 EAX09769 EAX09770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 100506403 101928269 861 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||