Homo sapiens Gene: SMPD1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-28681.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SMPD1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | sphingomyelin phosphodiesterase 1, acid lysosomal | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ASM; ASMASE; NPD | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000166311 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sphingomyelin phosphodiesterase 1, acid lysosomal
sphingomyelin phosphodiesterase 1, acid lysosomal
sphingomyelin phosphodiesterase 1, acid lysosomal
sphingomyelin phosphodiesterase 1, acid lysosomal
sphingomyelin phosphodiesterase 1, acid lysosomal
sphingomyelin phosphodiesterase 1, acid lysosomal
sphingomyelin phosphodiesterase 1, acid lysosomal
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a lysosomal acid sphingomyelinase that converts sphingomyelin to ceramide. The encoded protein also has phospholipase C activity. Defects in this gene are a cause of Niemann-Pick disease type A (NPA) and Niemann-Pick disease type B (NPB). Multiple transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:6390431-6394998 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p15.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 16 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Glycosphingolipid metabolism pathway
Sphingolipid metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Sphingolipid metabolism pathway
Lysosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Ceramide signaling pathway
TNF receptor signaling pathway
TRAIL signaling pathway
IL2 signaling events mediated by PI3K
FAS (CD95) signaling pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.498173 Hs.622566 Hs.726823 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000543 NM_001007593 XM_005253075 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31409 CCDS44531 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06353 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||