Homo sapiens Gene: CCR9 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-29830.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CCR9 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | chemokine (C-C motif) receptor 9 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CC-CKR-9; CDw199; GPR-9-6; GPR28 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000173585 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chemokine (C-C motif) receptor 9
chemokine (C-C motif) receptor 9
chemokine (C-C motif) receptor 9
chemokine (C-C motif) receptor 9
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the beta chemokine receptor family. It is predicted to be a seven transmembrane protein similar to G protein-coupled receptors. Chemokines and their receptors are key regulators of the thymocytes migration and maturation in normal and inflammation conditions. The specific ligand of this receptor is CCL25. It has been found that this gene is differentially expressed by T lymphocytes of small intestine and colon, suggested a role in the thymocytes recruitment and development that may permit functional specialization of immune responses in different segment of the gastrointestinal tract. This gene is mapped to the chemokine receptor gene cluster region. Two alternatively spliced transcript variants have been described. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:45886504-45903177 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p21.31 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
G alpha (i) signalling events pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Signaling by GPCR pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
GPCR ligand binding pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Chemokine signaling pathway pathway
Intestinal immune network for IgA production pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | C9JWC0 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10803 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.225946 Hs.671587 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001256369 NM_006641 NM_031200 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1610 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 604738 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2732 CCDS2733 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 09200 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC099782 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 10803 | ||||||||||||||||||||||