Homo sapiens Gene: SIAH1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-30112.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SIAH1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | siah E3 ubiquitin protein ligase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | SIAH1A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000196470 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
seven in absentia homolog 1 (Drosophila)
seven in absentia homolog 1 (Drosophila)
seven in absentia homolog 1 (Drosophila)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
SIAH1 is a ubiquitin ligase structurally related to TRAF and modulates TNF-alpha signalling.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein that is a member of the seven in absentia homolog (SIAH) family. The protein is an E3 ligase and is involved in ubiquitination and proteasome-mediated degradation of specific proteins. The activity of this ubiquitin ligase has been implicated in the development of certain forms of Parkinson's disease, the regulation of the cellular response to hypoxia and induction of apoptosis. Alternative splicing results in several additional transcript variants, some encoding different isoforms and others that have not been fully characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a protein that is a member of the seven in absentia homolog (SIAH) family. The protein is an E3 ligase and is involved in ubiquitination and proteasome-mediated degradation of specific proteins. The activity of this ubiquitin ligase has been implicated in the development of certain forms of Parkinson\'s disease, the regulation of the cellular response to hypoxia and induction of apoptosis. Alternative splicing results in several additional transcript variants, some encoding different isoforms and others that have not been fully characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:48356364-48448402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q12.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 125 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
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REACTOME |
Netrin-1 signaling pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
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KEGG |
Wnt signaling pathway pathway
Ubiquitin mediated proteolysis pathway
p53 signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8IUQ4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H3BU09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6477 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.730684 Hs.732204 Hs.734460 Hs.743277 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001006610 NM_003031 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10857 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 602212 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10735 CCDS32444 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC023818 AC026470 AJ400626 BC035562 BC042550 BC044920 BX647064 EF026094 U63295 U76247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC12950 AAC51907 AAH35562 AAH42550 AAH44920 ABK15529 CAC35542 CAE46191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 6477 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||