Homo sapiens Gene: TFCP2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-33112.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TFCP2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | transcription factor CP2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | LBP1C; LSF; LSF1D; SEF; TFCP2C | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000135457 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
transcription factor CP2
transcription factor CP2
transcription factor CP2
transcription factor CP2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a transcription factor that binds the alpha-globin promoter and activates transcription of the alpha-globin gene. The encoded protein regulates erythroid gene expression, plays a role in the transcriptional switch of globin gene promoters, and it activates many other cellular and viral gene promoters. The gene product interacts with certain inflammatory response factors, and polymorphisms of this gene may be involved in the pathogenesis of Alzheimer's disease. [provided by RefSeq, Mar 2010] This gene encodes a transcription factor that binds the alpha-globin promoter and activates transcription of the alpha-globin gene. The encoded protein regulates erythroid gene expression, plays a role in the transcriptional switch of globin gene promoters, and it activates many other cellular and viral gene promoters. The gene product interacts with certain inflammatory response factors, and polymorphisms of this gene may be involved in the pathogenesis of Alzheimer\'s disease. [provided by RefSeq, Mar 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:51093663-51173134 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q13.13 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 28 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by HDAC Class I
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.48849 Hs.715085 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001173452 NM_001173453 NM_005653 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS55827 CCDS8808 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 01790 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||