Homo sapiens Gene: SF3B14 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-33356.7 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | SF3B14 | ||||||||||||||||||
Gene Name | Pre-mRNA branch site protein p14 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000115128 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Pre-mRNA branch site protein p14
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a 14 kDa protein subunit of the splicing factor 3b complex. Splicing factor 3b associates with both the U2 and U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein complexes (U2 snRNP) of spliceosomes. This 14 kDa protein interacts directly with subunit 1 of the splicing factor 3b complex. This 14 kDa protein also interacts directly with the adenosine that carries out the first transesterification step of splicing at the pre-mRNA branch site. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:24067584-24076443 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | p23.3 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 68 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q9Y3B4 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 51639 | ||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||
RefSeq | NM_016047 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:30096 | ||||||||||||||||||
OMIM | 607835 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1707 | ||||||||||||||||||
HPRD | 09702 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AC008073 AF151868 AF161523 AF184213 AF401310 AK311908 BC015463 CH471053 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAD34105 AAF29138 AAG09698 AAH15463 AAK94041 AAY14664 BAG34849 EAX00767 | ||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 51639 | ||||||||||||||||||